Murat Ağırel, Adanalı bir ailenin oğlu olarak 23 Eylül 1980 yılında Ceyhan’da dünyaya geldi. Ağırel, ilk orta ve lise eğitimini Ceyhan’da gördü.
Murat Ağırel, Eskişehir Üniversitesi Dış Ticaret Bölümünden mezun oldu.
Murat Ağırel, 2006 yılında “Cumhuriyet Meclisi” internet sitesi çatısı altında taşındığı kişilerle “Birkaçkişiyiz Platformu”nu kurdu. Platformun bir süre İstanbul İl Başkanlığı yaptı.
Murat Ağırel, toplumsal meseleleri ilgilendiren olayların içerisinde yer aldı. Tepkisini ortaya koydu. Ağırel, 2007 Türkiye cumhurbaşkanlığı seçimi öncesinde dönemin Başbakanı Recep Tayyip Erdoğan’ın cumhurbaşkanı adaylığına karşı düzenlenen  “Cumhuriyet Mitingleri” organizasyonu içerisinde görev aldı. Ağırel yine, “Hukuka Saygı Mitingi”, “Teröre Lanet Mitingi”, “8 Mart Emekçi Dünya Kadınlar Günü” Mitingleri ve yürüyüş organizasyonları içerisinde bulundu. 
Memleket Sevdalıları Derneği’nin kurucu genel başkanlığını ve dört
dönem başkanlığını yaptı. 23 Eylül 2008 tarihinde gözaltına alındı. Ergenekon Davası’nda 11 bir yıl yargılandı ve davadan beraat etti.
Murat Ağırel, 22 Şubat 2020 tarihinde Twitter hesabından, Libya’da şehit olan iki MİT mensubu memurun isimlerini paylaştığı gerekçesiyle yargılandığı dava sonucunda 7 ay Silivri Cezaevinde tutuklu kaldı.
2017 yılında bazı haber sitelerinde yazılar yazmaya başladı. Yolsuzluk ve usulsüzlük dosyalarına ilişkin yazılar kaleme aldı, yargılandı.
YeniÇağ gazetesinde köşe yazarlığı yapan Ağırel, 2019 yılında Uluslararası Şeffaflık Derneği tarafından “Medya” dalında Şeffaflık Ödülü’ne de layık görüldü.
2019  yılında Türkiye Gazeteciler Cemiyeti tarafından ‘‘Yılın Gazetecisi’’ ödülünü aldı.
2020  yılında Basın Konseyi tarafından 2020 Basın Özgürlüğü Ödülü’nü aldı.
2020 yılında TMMOB Mimarlar Odası tarafından ‘’Emre Madran Dayanışma Ödülü’nü aldı.
Murat Ağırel’in Parsel Parsel, Şaki ve Sarmal isimli yayımlanmış 3 kitap çalışması vardır.
Murat Ağırel aynı zamanda HALK TV, Tele 1 gibi televizyon kanallarında yorumcu olarak değerlendirmelerde bulunuyor.
Dilek Ağırel ile evli olan Murat Ağırel biri erkek biri kız iki çocuk babasıdır
Murat Ağırel, Twitter’da @muratagirel kullanıcı adıyla güncel meseleler hakkında paylaşımlarda bulunuyor.